Curriculum vitae

Biodiversidad marina · Sistemática molecular · Ecología de poblaciones y comunidades · Biología evolutiva y biogeografía · Monitoreo de ecosistemas con ADN ambiental · Conservación de la fauna marina

Candidata del Sistema Nacional de Investigadoras e Investigadores (SNII, 2025–2028) · Miembro del Sistema Estatal de Investigadores de Baja California Sur (COSCYT)

Formación académica

• Doctorado en Ciencias en Ecología Marina, CICESE, 2022
  • Tesis: “Integrative study of connectivity in the Gulf of California seascape”. Codirectores: Dr. Axayácatl Rocha Olivares (CICESE) y Dr. Adrián Munguía Vega (Applied Genomics Lab, University of Arizona).
• Maestría en Ciencias en Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales, CIBNOR, 2014
  • Tesis: “Filogeografía y modelación de nicho ecológico en la iguana del desierto Dipsosaurus dorsalis en la península de Baja California”. Director: Dr. Francisco Javier García de León.
• Licenciatura en Biología, Facultad de Ciencias, UNAM, 2011
  • Tesis: “Genética poblacional en pastizales de Thalassia testudinum en la laguna arrecifal de Puerto Morelos, Quintana Roo”. Directora: Dra. Brigitta I. van Tussenbroek (ICMyL-UNAM).

Posiciones académicas

• Investigadora postdoctoral SECIHTI — Programa de Ecología Pesquera, CIBNOR (feb 2024 – presente)
  • Proyecto: “Biodiversidad marina mediante técnicas de ADN ambiental (metabarcoding, qPCR y ddPCR) en el Alto Golfo de California: el caso de las especies prioritarias Totoaba macdonaldi y Phocoena sinus”. Investigador responsable: Dr. Fausto Valenzuela Quiñonez.
  • Diseño y validación in silico, in vitro e in situ de sistemas de detección molecular especie-específicos; coordinación de campo y laboratorio; formación de estudiantes; colaboración con CONANP, CICESE y UABCS.
• Consultora científica, líder del componente de ADN ambiental — National Marine Mammal Foundation / NIWC Pacific (mar 2024 – presente)
  • Vaquita eDNA Project: diseño experimental, ejecución y análisis de la detección molecular de Phocoena sinus mediante ADN ambiental; coordinación técnica del equipo de muestreo.
• Investigadora postdoctoral — Whale and Dolphin Ecology Lab (Dra. Amy Van Cise), School of Aquatic and Fishery Sciences, University of Washington + NOAA Northwest Fisheries Science Center (mar 2023 – feb 2024)
  • Proyecto MMARINeDNA (Marine Mammal Remote detection via INnovative environmental DNA sampling): distribución tridimensional de cetáceos en el Sistema de la Corriente de California con metabarcoding de ADN ambiental y GAMs. Mentora: Dra. Amy Van Cise; colaboradores: Dr. Ryan Kelly y Dra. Kim Parsons.
• Investigadora líder — Cetacean Action Treasury (jun 2021 – dic 2022)
  • “Pilot Project to Test Viability of Detecting Vaquita Porpoise Presence through Environmental DNA”: diseño experimental, trabajo de campo y laboratorio, y reporte científico.
• Asistente de investigación — Applied Genomics Lab, University of Arizona (nov 2021 – ene 2022; ago – oct 2022)
  • Consultoría para Oceana México: “Biodiversidad marina en Arrecife Alacranes y Bajos del Norte mediante metabarcoding de ADN ambiental” (12S y COI). Supervisor: Dr. Adrián Munguía Vega.
• Asistente de investigación — LANGEBIO, CINVESTAV-IPN (sep 2014 – mar 2015)
  • Códigos de barra de ADN y tolerancia térmica en salamandras; muestreo de ADN ambiental en cuevas. Supervisor: Dr. Sean Rovito.
• Asistente de investigación — Laboratorio de Genética para la Conservación, CIBNOR (2010–2022, cuatro periodos)
  • “Filogeografía comparada del noroeste de México” (2010–2011); “Taxonomía molecular y genética poblacional de la medusa bola de cañón Stomolophus meleagris” (2014); “Variabilidad genética y probable origen de poblaciones colonizadoras en el área afectada por el buque tanque Lázaro Cárdenas II” (2014); Programa de Ecología Pesquera (2022).

Proyectos de investigación

Como investigadora principal o líder científica

• Vaquita eDNA Project: A Validated eDNA Workflow for Vaquita Monitoring (nov 2025 – vigente)
  • Investigadora principal. Financiamiento: Dolphin Quest Research & Grants Committee. Co-PI: Dra. Barbara Taylor.
  • Consorcio internacional con el Dr. Lorenzo Rojas Bracho (PNUD), el Dr. Gustavo Cárdenas Hinojosa (CONANP), la Dra. Valeria Towns (Pronatura Noroeste), la Dra. Kristin Nowell (Cetacean Action Treasury) y el Dr. Fausto Valenzuela Quiñonez (CIBNOR).
  • Incluye un componente de ciencia ciudadana con la Dirección de la Reserva de la Biosfera Alto Golfo de California y Delta del Río Colorado (CONANP).
• Vaquita eDNA Project / Operation Esperanza — National Marine Mammal Foundation / NIWC Pacific (2024 – vigente)
  • Líder del componente de ADN ambiental: ensayos moleculares, optimización del muestreo, coordinación del equipo e informe integral.
• Pilot Vaquita eDNA Project — Cetacean Action Treasury (2021–2022)
  • Investigadora líder. Financiamiento: SeaWorld & Busch Gardens Conservation Fund y Society for Marine Mammalogy; equipo oceanográfico del eDNA Collaborative (University of Washington).

Como colaboradora

• “Del genoma al ensamblaje de especies: evaluación de los procesos evolutivos neutrales, selectivos y funcionales que estructuran la biodiversidad en ambientes marinos” — Ciencia Básica y de Frontera CBF-2026-4124, SECIHTI; responsable técnico: Dr. Fausto Valenzuela Quiñonez, CIBNOR; consorcio CIBNOR, CICESE y UABCS (2026–2028)
• “La diversidad genética y funcional de los dinoflagelados de la familia Symbiodiniaceae como bioindicadores de resiliencia en las comunidades coralinas del Pacífico mexicano” — Ciencia Básica y de Frontera CBF-2026-1572, SECIHTI; responsable técnico: Dr. Manuel Alejandro Delgadillo Nuño, CICESE; con CIBNOR, Universidad de Colima y UAM (2026–2028)
• Pez remo (Regalecus glesne) — colaboración con Fernanda Raygoza Díaz (2026 – vigente)
• MAR-Gen Caribe: Metabarcoding para la Biodiversidad del Caribe Mexicano — Healthy Reefs for Healthy People (2025 – vigente)
• “Mareas doradas: entendiendo la biología del sargazo y explorando su potencial en la acuacultura” — Ciencia de Frontera CBF 2023-2024-1414, SECIHTI; responsable: Dra. Brigitta I. van Tussenbroek, ICMyL-UNAM (2025 – vigente)
• “Biodiversidad marina mediante técnicas de ADN ambiental (metabarcoding, qPCR y ddPCR) en el Alto Golfo de California: el caso de las especies prioritarias Totoaba macdonaldi y Phocoena sinus” — Estancias Posdoctorales por México, SECIHTI; responsable: Dr. Fausto Valenzuela Quiñonez, CIBNOR; investigadora postdoctoral (2024 – vigente)
• MMARINeDNA: Marine Mammal Remote detection via INnovative environmental DNA sampling — Whale and Dolphin Ecology Lab, University of Washington, y NOAA Northwest Fisheries Science Center; investigadora postdoctoral (2023–2024)
• “Patrones convergentes evolutivos de adaptación local en el ambiente marino” — Fronteras de la Ciencia FOP16-2021-01-321016; líder: Dr. Fausto Valenzuela Quiñonez, CIBNOR (2022–2023)
• Arrecife Alacranes — Oceana México / Applied Genomics Lab, University of Arizona (2021–2022)
• “Desarrollo de herramientas de ADN ambiental para monitorear cambios en la biodiversidad marina en el Golfo de California” — National Geographic Explorer Grant; líder: Dr. Adrián Munguía Vega (2019–2020)
• Herramientas de monitoreo con ADN ambiental en reservas marinas del Golfo de California — Consortium for Arizona-Mexico Arid Environments (CAZMEX); líderes: Dra. Melanie Culver (University of Arizona) y Dr. Héctor Reyes Bonilla (UABCS) (2019)

Financiamiento obtenido

Para investigación

• Eric A. Ramos Small Grant in Aid of Research, Society for Marine Mammalogy: muestreo de ADN ambiental de vaquita en el Área de Tolerancia Cero del Refugio de la Vaquita, Alto Golfo de California. Una de seis propuestas financiadas entre 57, 2026.
• Dolphin Quest Research & Grants Committee: Vaquita eDNA Project: A Validated eDNA Workflow for Vaquita Monitoring. Investigadora principal (co-PI: Dra. Barbara Taylor), 2025.
• SeaWorld & Busch Gardens Conservation Fund: Pilot Vaquita eDNA Project, Cetacean Action Treasury. Investigadora líder, 2021.
• Society for Marine Mammalogy: Pilot Vaquita eDNA Project, Cetacean Action Treasury. Investigadora líder, 2021.
• Microbeca del eDNA Collaborative (University of Washington): equipo oceanográfico para el proyecto piloto de vaquita, 2022.
• Illumina Core-Lab Sequencing Grant: “Nuevas técnicas de evaluación de biodiversidad marina en el Golfo de California mediante el uso de ADN ambiental”, 2017.

Becas

• Beca para investigación posdoctoral, SECIHTI (antes CONAHCyT), 2024–2029
• Beca para investigación posdoctoral, University of Washington, 2023–2024
• Beca para estudios de doctorado, CONACyT, 2016–2020
• Beca para estudios de maestría, CONACyT, 2011–2013

Reconocimientos y membresías

• Candidata del Sistema Nacional de Investigadoras e Investigadores (SNII), SECIHTI, 2025–2028
• Miembro del Sistema Estatal de Investigadores de Baja California Sur (COSCYT), 2024 – vigente

Docencia

Cursos de posgrado

• Metabarcoding de comunidades de eucariontes — Posgrado en Ciencias del Mar y Limnología, UNAM (noviembre de 2025); Educación Continua, CIBNOR (marzo de 2026).
  • Diseñé e impartí este curso práctico de cinco días sobre metabarcoding de ADN ambiental en comunidades de eucariontes, desde el diseño de muestreo hasta el análisis bioinformático y estadístico en R. Página del curso · Código
• Introducción al análisis espacial en ecología — Maestría en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales, CIBNOR (mayo–agosto de 2025).
  • Profesora participante en el curso coordinado por el Dr. Pedro Peña Garcillán. Impartí los conceptos teóricos de la estructura espacial en ecología, el análisis e interpretación de patrones de distribución espacial de variables ecológicas, y herramientas estadísticas y de programación en R para procesar, visualizar y evaluar datos espaciales.
• Genética para la Conservación — Maestría en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales, CIBNOR (mayo–agosto de 2025).
  • Profesora participante en el curso coordinado por el Dr. Francisco Javier García de León.
• Sistemática (micro y macroevolución) — Maestría en Ciencias en el Uso, Manejo y Preservación de los Recursos Naturales, CIBNOR (primer trimestre de 2025).
  • Impartí el módulo de filogenómica y casos de estudio sobre herramientas innovadoras para el estudio de la biodiversidad (especies y comunidades) de ambientes terrestres y marinos. Curso coordinado por el Dr. David A. Paz García y el Dr. Alejandro Valdez Mondragón.

Formación práctica y talleres

• Capacitación comunitaria en muestreo y procesamiento de ADN ambiental — San Felipe, Baja California (2026), como parte del proyecto Dolphin Quest. 12 participantes: habitantes de San Felipe, integrantes de Pesca ABC y personal de la CONANP y la Secretaría de Marina. Incluyó prácticas a bordo y la entrega de un Manual de ADN Ambiental.
• Prácticas de laboratorio para estudiantes de Ingeniería en Agronomía de la UABC — visita al CIBNOR (noviembre de 2025).
• Capacitación en muestreo de ADN ambiental en arrecifes — Healthy Reefs for Healthy People, Caribe mexicano (2025): codiseño del muestreo y entrenamiento del equipo en campo.
• Capacitadora en el 3rd Marine Mammal eDNA Workshop — 25th Biennial Conference on the Biology of Marine Mammals, Perth, Australia (2024).
• Coordinadora del taller “Metabarcoding de comunidades de eucariontes” — CIBNOR (2020).
• Ponente invitada en el 1er Taller de ADN Ambiental — UABCS (2019): introducción al metabarcoding para el estudio de organismos marinos.
• Mentora del programa “Mujeres líderes en STEAM” — British Council (2019).
• Organizadora del taller “Introduction to statistical analysis for landscape genetics” — CIBNOR (2013).

Dirección de estudiantes

Ver la página de Estudiantes.

Software y repositorios abiertos

Más de 25 repositorios públicos en GitHub, con pipelines bioinformáticos y análisis reproducibles. Destacan:

• metabarcoding_QAQC_pipeline: pipeline colaborativo de control de calidad para metabarcoding de ADN ambiental (red MMARINeDNA, University of Washington y NOAA).
• eDNAoccurrenceSDM: herramienta en R que integra GAMs con datos de ocurrencia de metabarcoding para modelos de distribución de especies marinas.
• MolEcolRes_Valdivia_etal_2021: repositorio de reproducibilidad de Valdivia-Carrillo et al. (2021), Molecular Ecology Resources.
• Curso de metabarcoding: materiales y código del curso.

Habilidades técnicas y computacionales

• Ecología molecular: extracción y cuantificación de ADN y ADN ambiental (Qubit, NanoDrop, Bioanalyzer); diseño y validación de ensayos qPCR (CFX96) y ddPCR (QX200) especie-específicos; bibliotecas para Illumina (MiSeq, NovaSeq) y Nanopore (MinION); metabarcoding (12S, 16S, 18S, COI, ITS); RAD-seq y ddRAD-seq; microsatélites; secuenciación Sanger.
• Bioinformática y cómputo de alto rendimiento: metabarcoding y genómica de poblaciones; clúster Hyak (UW), servidores del NOAA NWFSC e infraestructura del CIBNOR y la UNAM.
• Modelación estadística: GAMs, GAMMs, GLMs, modelos de distribución de especies (incluidos bayesianos), nicho ecológico (Maxent) y aprendizaje automático.
• Programación y SIG: R, UNIX; ArcGIS, QGIS.

Cursos y talleres recibidos

Análisis estadístico y modelación ecológica

• Species Distribution Modelling with Bayesian Statistics using R — Dra. Márcia Barbosa (2024)
• Generalized Additive Mixed Models (GAMMs) — Dr. Antonio Canepa, Universidad de Burgos (2023)
• Generalized Linear Models (GLMs) — Dr. Florian Hartig (2023)
• Generalized Additive Models (GAMs) — Dr. Gavin Simpson, Aarhus University (2023)
• Estructura de Redes Dinámicas — Dr. Guillermo de Anda Jáuregui, INMEGEN / UNAM (2021)

Bioinformática, genómica y metabarcoding

• Metagenomic Analysis — Talleres Internacionales de Bioinformática TIB2024-2 (2024)
• Abalone Whole Genome Sequencing analysis — Dr. Brock Wooldridge (2024)
• Taller avanzado de bioinformática — UNAM, CINVESTAV Irapuato, INB-UNAM (2021)
• Ensamblado y Anotación de Genomas y Metagenomas — Dr. Luis Lozano, CCG-UNAM, Red Mexicana de Bioinformática (2020)
• Seascape Genomics — Dra. Laura Benestan y Dr. Oliver Selmoni, Physalia Courses (2020)
• Metabarcoding de Eucariotas — Dr. Owen Wangensteen y Dra. Sandra Garcés Pastor, Physalia Courses (CIBNOR 2020; UCR, Costa Rica 2019)
• RADseq — Dra. Naiara Rodríguez Ezpeleta, Physalia Courses (2020)
• 9th Metabarcoding Spring School — Dr. Pierre Taberlet et al., Universidad de los Andes, Colombia (2019)
• Seminario de Genética del Paisaje — Dra. Helene Wagner (2018)
• Metagenomas y Metatranscriptomas Ambientales — Dr. Titus Brown et al., UC Davis / CICESE (2017)
• Análisis de Datos RADseq — Dr. Julian Catchen y Dr. Christopher Smith, CICESE (2016)

Revisión por pares y evaluación

• Revisora ad hoc: Environmental DNA (Wiley; certificado de revisora 2025), Molecular Ecology Resources, Journal of Fish Biology, Aquatic Botany, Conservation Genetics Resources, Frontiers in Marine Science, Frontiers in Mammal Science, Frontiers of Biogeography, Metabarcoding and Metagenomics, Recursos Naturales y Sociedad.
• Jurado evaluador de proyectos, Consejo Sudcaliforniano de Ciencia y Tecnología (COSCYT/COSHCYTI), convocatorias 2025 y 2026.
• Evaluadora, Convocatoria de Estancias Posdoctorales por México, SECIHTI, 2025.

Trabajo de campo

• Expediciones para el muestreo de vaquita marina en el Área de Tolerancia Cero del Alto Golfo de California, 2022, 2024 y 2026 — muestreo y procesamiento de ADN ambiental.
• Expediciones científicas en el Golfo de California a bordo del “Quino el Guardián”, 2018 y 2019 — muestreo y procesamiento de ADN ambiental.
• Muestreo de ADN ambiental en arrecifes del Caribe mexicano (Cancún, Isla Mujeres–Punta Nizuc y Puerto Morelos), 2025.
• Muestreo de salamandras en Morelos, México, 2014.
• Muestreo de reptiles en Baja California, México, 2012.
• Muestreo de cactus en Baja California, México, 2011.
• Estudios de pastos marinos, algas y corales en el Caribe Mexicano, 2008–2010.

Certificaciones de buceo

• Buceador Científico CMAS — ICMyL-UNAM, Puerto Morelos, 2008
• Buceador Dos Estrellas FMAS/CMAS (Federación Mexicana de Actividades Subacuáticas) — ICMyL-UNAM, Puerto Morelos, 2008
• Buceador Una Estrella CMAS — Facultad de Ciencias, UNAM, 2007

Idiomas

• Español (nativo)
• Inglés (hablado, escrito y comprendido)